Más recientemente, en la temporada 1999/2000, la Gimnástica batió todos los récords de todas las divisiones del fútbol Nacional, quedando campeona del grupo II de la Segunda División B, siendo el equipo que más puntos logró (78), camisetas futbol baratas el máximo goleador (59) y el menos goleado (18). La mala suerte se cebó de nuevo con el conjunto blanquiazul que no pudo alcanzar el tan ansiado ascenso a Segunda División A por un solo gol. Los 23 jugadores elegidos acudían al máximo torneo continental con la suma de 210 títulos en su palmarés y únicamente Jordi Alba no engrosaba dicha lista. En la temporada 2004/05 jugadores y aficionados realizaron un encierro de más de un mes en los vestuarios de El Malecón en protesta por falta de pagos a la plantilla durante muchos meses, debido a la mala gestión de la directiva. En 1922 junto a Peñarol y otros clubes fundó, durante el cisma del fútbol uruguayo, la Federación Uruguaya de Football, comprometido por su amistad deportiva con los equipos disidentes argentinos, principalmente los de Avellaneda: Racing e Independiente. Pequeña Copa del Mundo de Clubes en Caracas. Otra brillante página en la historia del club es la que escribió en la Copa del Rey, competición en la que logró alcanzar los octavos de final en la temporada 2000/2001 cuando militaba en 2.ªB, tras derrotar a equipos de Primera división como el Deportivo Alavés (finalista de la Copa de la UEFA esa temporada) y la Unión Deportiva Las Palmas y poner en apuros al Fútbol Club Barcelona empatando en el Camp Nou 0-0 y quedando eliminada merced a un solitario gol de Rivaldo en El Malecón.

A nivel local la Gimnástica disputa derbis con otros equipos del municipio como el Club Deportivo Tropezón de Tanos o el Barreda Balompié. Torneo Apertura (A) y el Torneo Clausura (C) de la Primera División Venezolana de Fútbol 2007/08. Las filas corresponden a los juegos de local mientras que las columnas corresponden a los juegos de visitante de cada uno de los equipos. En la temporada 2007/08 militó en el grupo cántabro de la Tercera División donde se proclamó campeón, con un récord histórico nacional al alcanzar los 100 puntos, camisetas futbol 2024 habiendo marcado 113 goles. La última vez que se enfrentaron en competición oficial fue en la temporada 2018/19, ambos en 2.ªB, con victoria por 1 a 0 de los racinguistas en los Campos de Sport del Sardinero y empate a cero goles en el estadio de El Malecón. El campeón defensor es el Zamora FC quien obtuvo su segundo título luego de sumar un global de 4 goles contra 3 del CD Mineros de Guayana como resultado de los partidos de ida y vuelta de la «Gran Final» con marcadores de (4 – 1) el día 18 de mayo del 2014 en el Estadio Agustín Tovar de la ciudad de Barinas y de (2 – 0) el día 25 de mayo del 2014 en el CTE Cachamay de Ciudad Guayana.

Diversos actos culturales y deportivos ocuparon el panorama de la ciudad durante los 365 días. Durante la guerra civil española el estadio de El Malecón sufrió un bombardeo por parte de la aviación Rebelde. Un reportero intentó entrevistar a un jugador durante un partido y antes de que el primer tiempo hubiese terminado gran parte del público se retiró del estadio. El 13 de abril de 2004 durante unas mejoras para el terreno de juego de El Malecón, los operarios encargados de la obra encontraron un proyectil de la Guerra Civil (1936-39) de 75 centímetros de longitud y cargado con 25 kilos de explosivo. Durante el año 2007, celebró el centenario de su fundación. Juan Carlos I cumpliendo así la promesa que este hizo al club de participar en los actos del centenario. El club se encuentra actualmente en proceso de liquidación desde diciembre de 2022, aunque el promotor de dicho proceso, el Alcalde de Burgos, Don Daniel de la Rosa, prefiere guardar silencio y no se ha vuelto a saber nada de este tema. Este campeonato contó con seis equipos y fue el primero jugado en dos rondas con un sistema de todos contra todos.

La mejor temporada, con uno de los mejores equipos que se recuerda en la capital del Besaya, fue la 49/50, cuando estuvo a punto de subir a Primera División, pero una derrota en el último partido en Villagarcía de Arosa le privó de su sueño. Tan sólo una vez ha superado en la clasificación de Liga al Racing de Santander. Mejor clasificación en Tercera División: 1.º (10 veces). El conjunto de Torrelavega se vuelve a proclamar campeón de la Tercera División en la temporada 2008-09, a falta de cuatro jornadas para el final de la liga, y tras superar al Lagun Onak de Azpeitia en la primera eliminatoria de ascenso retornando así a la Segunda B del fútbol español. Torrelavega : Ediciones Garcilaso, D.L. El escudo está formado por dos círculos concéntricos entre los cuales se puede leer la inscripción sobre fondo blanco: Real Sociedad Gimnástica Torrelavega. La Real Sociedad Gimnástica de Torrelavega eliminó su filial del organigrama del club por los problemas económicos que asolaban al club. Tras otro ejercicio de mala suerte el club caería eliminado por el Futbol Club Santboià en la primera eliminatoria de la promoción de ascenso a Segunda División B, lo que condenó al equipo blanquiazul a disputar la temporada 2008/09 en la Tercera División.