Fue creado el Instituto de Historia y Estadística del Fútbol Chileno en 1995 y el Instituto Nacional del Fútbol en 1997. Durante los años 2000, se instalaron las sociedades anónimas deportivas ante la quiebra de varios clubes. Allá por la jornada 27 el Villarreal estaba sexto a sólo tres puntos del Sevilla F. C., mientras que en la UEFA el Villarreal pierde en la ida (1-3) en El Madrigal ante el Sevilla. El Villarreal venció en el Astana Arena por (0-3) y en El Madrigal por (4-0),consiguiendo el pase a la fase de grupos de la UEFA Europa League. Tras su victoria en la final de la Europa League, consiguió un cupo para disputar la Liga de Campeones de la UEFA 2021-22 donde el fútbol español tendrá cinco equipos en dicha competición continental (Atlético, Real Madrid, Barcelona, camiseta fútbol Sevilla y Villarreal). En vísperas de la Eurocopa 2016, el Villarreal, junto al F. C. Barcelona, fueron los dos únicos clubs con representación en todas las categorías de la selección española de fútbol (sub-17, sub-19, sub-21 y absoluta).
Después de los resultados que las selecciones sub-20 y sub-17 obtuvieron en los mundiales Sub-17 y Sub-20, con jugadoras, en su mayoría mexico-americanas, el 5 de diciembre de 2016, se anunció la creación de una Liga MX Femenil que tendría como objetivo la producción de jugadoras nacionales. La ciudad deportiva dispone de una residencia para las jóvenes promesas de la cantera que vienen de cualquier parte del mundo, pero sobre todo de los alrededores y comarcas cercanas. La programación juvenil también forma parte importante del canal, entre estos destacan el programa de vídeos La zona, Cinescape conducido por Rolando Martínez. Para mantener la posesión del balón es esencial tener capacidad para pasarlo en corto entre los jugadores cercanos de forma precisa y a tiempo. La victoria certificó la cuarta posición de forma matemática, y por tanto, el club castellonense disputaría la fase previa de la Liga de Campeones de la UEFA/UEFA Champions League, con la posibilidad de alcanzar las cuatro participaciones en la máxima competición europea de clubes. En sus inicios el Villarreal mantuvo una rivalidad con el Club Deportivo Burriana, ya que además de ser ciudades vecinas, solían jugar en la misma categoría.
En la fase de grupos, el Villarreal compartió grupo con Manchester United, Young Boys y Atalanta B. C.. En la fase de grupos, venció a los dos primeros por 1:0, pero cayó ante los españoles por 2:1. En octavos de final se encontró con Brasil y cayó por 3:0, finalizando su participación en el mundial realizado en Sudáfrica, consiguiendo el 10.º lugar de la clasificación general. El 13 de mayo de 2012, tras perder en los últimos instantes con el Atlético de Madrid por 0-1 con gol de Falcao en El Madrigal, el Villarreal desciende a la Segunda División, tras acabar en el 18° lugar en la temporada 2011-2012, después de 12 años consecutivos en la máxima competición. En 1929 se creó la Liga y el Real Murcia quedó encuadrado en el grupo B de la Segunda División, que un año después pasaría a llamarse Tercera División. Avanzó segundo de grupo con 10 puntos, destacando la victoria en la última jornada frente a Atalanta B. C. (3-2) que le dio un boleto para octavos de final en donde se enfrentó a la Juventus de Turín. Uruguay afrontaría una nueva edición de la Copa América en búsqueda del titulo 16.° donde quedo ubicada en el Grupo C junto al anfitrión Estados Unidos, Panamá y Bolivia, el 23 de junio, la celeste debutó ante Panamá en Miami saliendo victoriosa por un marcador de 1-3 con goles de Maximiliano Araújo, Darwin Núñez y Matías Viña para la celeste mientras que para el equipo panameño descontó Michael Murillo, en su segunda salida se enfrentó a Bolivia en Nueva York donde vapuleó al equipo boliviano por 5-0 con tantos de Facundo Pellistri, Darwin Núñez, Maximiliano Araújo, Federico Valverde y Rodrigo Bentancur clasificando anticipadamente mostrando un futbol agresivo y atractivo.
GUY Guyana Federación de Fútbol de Guyana Concacaf A pesar de estar geográficamente en América del Sur, Guyana optó por integrar la Concacaf. El Villarreal fue elegido además por la LFP como el mejor club del mes de diciembre, en el que el equipo contó todos sus partidos por victorias. Real Madrid Castilla por 5-0. La directiva refuerza el equipo con Chechu Dorado, Jonathan Pereira, Juanma, Perbet y Aquino en el mercado invernal. De cara a la nueva temporada, el Villarreal realiza una remodelación de la plantilla, vendiendo a futbolistas como Ikechukwu Uche, Gerard Moreno, Chechu Dorado o Luciano Vietto, y cediendo a jóvenes talentos como Moi Gómez o Sergio Marcos González. ↑ a b «¿Por qué al Villarreal se le llama ‘submarino amarillo’? ». ¿Por qué al Villarreal se le llama ‘submarino amarillo’? Armada de España había retirado, el S-63 Marsopa, de 58 metros de eslora y más de 1000 toneladas, fuera cedido a la ciudad de Villarreal para instalarlo en la población e incluso ubicar un museo en su interior.